在南京城里，虽说军务是由南京兵部尚书、南京守备太监、南京守备提督勋贵三人会同主管的，可权柄却也是有大有小。每逢有事，总是以南京兵部尚书为首提点军队，南京守备太监为监军使者，南京提督勋贵虽是兵部尚书的副手，却并没有什么发言权，往往是个摆设而已。

不过大明朝也有特例。

譬如世代镇守云南的黔国公沐家，因兵权同云南巡抚衙门重叠，因此在嘉靖年间曾经闹出过一场大的风波。最后还是嘉靖皇帝出面，要云南军务尽归黔国公府......